Bağırsak mikrobiyomunu duyduğunuzda, kendi vücudunuzda hangi küçük yaratıkların iç içe olduğunu merak ettiniz mi? Bitkilerin, hayvanların ve insanların mikrobiyomlarını inceleyen bir mikrobiyolog olarak , insan sağlığı üzerindeki olası dramatik  etkileri üzerine araştırmaların yanı sıra halkın bağırsak mikroplarına olan ilgisinin arttığını izledim . Geçtiğimiz birkaç yılda benim gibi araştırmacılar tarafından kullanılan mikrobiyom test teknikleri artık tüketicilere evlerinde sunuluyor. Bu kişisel bağırsak mikrobiyomu test kitleri, bağırsağınızda hangi organizmaların yaşadığını ve bu verileri kullanarak bağırsak mikrobiyomunuzu nasıl iyileştireceğinizi size söylediğini iddia ediyor.

Bu ev test kitlerinin nasıl çalıştığı, ne tür bilgiler sağladıkları ve bağırsak mikrobiyomunuzu değiştirmenize gerçekten yardımcı olup olamayacaklarıyla çok ilgilenmeye başladım. Bu yüzden Viome, Biohm ve Floré’den birkaç kit sipariş ettim, onları denedim ve kendi mikrobiyom verilerimi inceledim. İşte öğrendiklerim.

Bağırsak mikrobiyom kitleri nasıl çalışır?

Tüm bağırsak mikrobiyom kitleri, taze fekal materyali dikkatli bir şekilde toplamanızı gerektirir. Kitte verilen çeşitli tüplere koyarsınız ve numuneleri şirkete geri gönderirsiniz. Birkaç hafta sonra, bağırsaklarınızda yaşayan mikrop türlerini ve bağırsak mikrobiyomunuzu potansiyel olarak değiştirmek için diyetinizi veya aktivitelerinizi nasıl değiştireceğinize dair önerileri açıklayan bir rapor alacaksınız.

Tüketicilerin tam olarak bilmediği şey, şirketlerin dışkı örneğinden mikrobiyal profil verilerini nasıl oluşturduğudur. Ben ve diğer mikrobiyom araştırmacılarının kullandığı tipik bir yaklaşım, bir örnekten mikrobiyal genetik materyali çıkarmak ve kodunu çözmektir. Bu genetik materyali, hangi tür mikropların mevcut olduğunu belirlemek için kullanırız. Buradaki zorluk, bu sürecin birçok farklı yolla yapılabilmesi ve en iyi yöntemin ne olduğu konusunda geniş çapta üzerinde anlaşmaya varılmış standartların olmamasıdır.

Örneğin, mikrobiyom analizleri iki tür genetik materyal, RNA veya DNA üzerinde yapılabilir . Profil DNA’ya dayanıyorsa, size hangi mikrobiyal genlerin aktif olduğu veya vücudunuzda hangi aktiviteleri yaptıkları değil, yalnızca ne tür mikropların mevcut olduğuna dair bir anlık görüntü verebilir. Öte yandan, profil RNA’ya dayanıyorsa, yalnızca hangi mikropların bulunduğunu değil, aynı zamanda diğer işlevlerin yanı sıra sindiriminizde veya bağırsak iltihabını azaltabilecek metabolitler üretip üretmediğini de söyleyebilir. Viome , profillerini RNA’ya bakarak oluştururken, diğer şirketler DNA kullanıyor.

Farklı türde genetik dizilerin nasıl sıralandığı veya mikropları tanımlamak için hangi veri tabanlarının kullanıldığı gibi diğer veri analizi seçenekleri de ayrıntı düzeyini ve nihai verilerin faydasını etkileyebilir. Mikrobiyom bilim adamları, bilimsel makalelerde kendi verilerini yorumlarken genellikle bu nüanslara dikkat çekerler, ancak bu ayrıntılar ev mikrobiyom kitlerinde açıkça sunulmaz.

Bağırsak mikrobiyomum hakkında öğrendiklerim

Her kit için aynı dışkı örneğini kullanmama ve homojenliği sağlamak için iyice karıştırmama rağmen, denediğim üç ürünün her birinin bağırsak mikrobiyomum hakkında farklı izlenimler vermesine şaşırdım.

Her şirket, mikrobiyomunuzun “iyi” veya “sağlıklı” olduğunu düşündükleri şeylerle nasıl karşılaştırıldığına dair genel bir “puan” verir. Puanlarım %39 (çok iyi değil) ile %72 (iyi) arasında değişiyordu. İlginç bir şekilde, RNA kullanarak mikrobiyal aktiviteyi çıkaran Viome en düşük puanı verdi. Metan üretimi ve sindirim verimliliği gibi bağırsaklarımda meydana gelen belirli mikrobiyal faaliyetlerin optimal olmadığını kaydetti.

Ayrıca her şirketin bildirdiği toplam mikrobiyal çeşitlilikteki değişiklik beni şaşırttı. Daha genel bir biyolojik gruplama olan filum düzeyinde bulunan mikropların genel gruplarında genel bir anlaşma varken, en spesifik gruplama olan tür düzeyinde çok büyük bir çeşitlilik vardı. Bir şirket mikrobiyomda 527 mikrop türü rapor ederken, bir başkası 312 rapor etti. Biri sadece 27 rapor etti.

Belki de en şaşırtıcı bulgu, eğer belirli tıbbi durumlarla karşılaşırsam, bağırsaklarımda (burada birçok uyarı var!) gelecekte benim için sorun oluşturabilecek bir mikrop barındırabileceğiydi. Tüm şirketler bağırsak mikrobiyom örneğimde bu mikrobu açıkça aramış olsa da, sadece ikisi onu gerçekten buldu. Sağlık gizliliğimi korumak için tam mikrobun adını vermeyecek olsam da, bu sonuç hakkında çok endişeli değilim çünkü bunun gerçekten endişe verici bir tür olup olmadığını daha iyi anlamak için mikrobun tam genom dizilimi gibi daha fazla bilgiye ihtiyaç var. mikrop. Ancak bu bulgu, farklı test kitlerindeki sonuçlarda bazı şaşırtıcı farklılıklara işaret ediyor.

Bu veriler bağırsak mikrobiyomunuzu gerçekten iyileştirebilir mi?

Benim gibi birçok mikrobiyom bilimcisi, muhtemelen bu kitlerin sağladığı verilerin, sağlığınızı değiştirme gücü verme açısından sınırlı olduğunu iddia edecektir. Bunun nedeni kısmen, bağırsak mikrobiyomu biliminin hala cevaplanmamış birçok soruyla yeni bir alan olmasıdır.

Bir zorluk, farklı insanların bağırsaklarında farklı oranlarda mikroplara sahip olabilmesidir. Bu çeşitlilik, bilim insanlarının ve sağlık uzmanlarının, ne tür bir mikrobiyal topluluğun bir bağırsağı “sağlıklı” yaptığı konusunda hemfikir olmasını zorlaştırdı . C. diff bakterisi gibi bazı spesifik türler ve Proteobacteria gibi bazı geniş gruplar genellikle yüksek miktarlarda istenmeyen olarak kabul edilir. Ancak bir mikrobiyomun neden diğerinden daha iyi olabileceği konusunda net bir fikir birliği yoktur.

Bağırsak mikrobiyomunuzu bağırsak testinizin size söylediklerine göre iyileştirmeye çalışsanız bile sonuçlar umduğunuz gibi çıkmayabilir. Probiyotikler veya diyet değişiklikleri, bağırsak mikrobiyomunuzun çeşitliliğini ve nasıl çalıştığını değiştirebilir, ancak araştırmalar, muhtemelen her insanın, muhtemelen kendi benzersiz mikrobiyom bileşimi nedeniyle, bu müdahalelere farklı tepkiler verebileceğini bulur . Genetik, diyet ve diğer faktörlerle birleşen bağırsak mikrobiyal topluluklarının kişiselleştirilmiş ekolojisi, evrensel çözümler reçete etmeyi zorlaştırıyor.

Öyleyse neden bir bağırsak mikrobiyom testi yaptırma zahmetine giresiniz? Her gün yanımda taşıdığım mikropları öğrenmek benim için aydınlatıcı oldu. Öğle yemeğimi yediğimde, koşuya çıktığımda veya strese girdiğimde bağırsaklarımdaki mikroplar vücudumdaki değişikliklere tepki veriyor. Araştırmacılar, bu değişikliklerin ne anlama geldiğini ve mikrobiyal ortaklarımızı nasıl yöneteceklerini tam olarak anlayamayabilirler, ancak kim olduklarını bilmek harika bir ilk adımdır.